Tôta a ramené à la vie son grand-père, Negi Springfield, le Magister Magi. À eux deux, ils sont assez puissants pour contrer Yolda Baoth et l'empêcher de plonger l'humanité dans le sommeil. La stratégie mise en place à l'avance par Yukihime repose actuellement sur Honoka et Isana, qui doivent s'enfuir assez loin pour stopper le sort de Yolda. Mais celle-ci ne l'entend pas de cette oreille et se lance à la poursuite des deux sœurs.