Pour éviter l'impact d'un missile nucléaire sur la station orbitale du Japon, Tôta et ses amis doivent parcourir 300 kilomètres en une demi-heure le long de l'escalier de la tour. Arrivés à destination, les numéros de UQ Holder se déploient à leurs postes respectifs : Tôta, Karin et Gengorô sont téléportés sur le missile pour arrêter sa course et capturer l'ennemi qui le dirige. Mais vont-ils réussir avant que le terroriste ne largue les ogives ?